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用DNA存數(shù)據(jù),福建科研團(tuán)隊(duì)獲重要突破

http://duobangwang.com  2024-08-20 16:30:22   來源:福建日報(bào)  【字號

  記者從嘉庚創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)室獲悉,該實(shí)驗(yàn)室楊朝勇教授和張惠敏副研究員團(tuán)隊(duì)在DNA信息存儲領(lǐng)域取得重要突破,近日,相關(guān)成果發(fā)表于《美國國家科學(xué)院院刊》。

  信息化浪潮帶動了數(shù)字經(jīng)濟(jì)和人工智能等新興技術(shù)的高速發(fā)展,隨之而來的是全球數(shù)據(jù)產(chǎn)出量的爆炸式增長。全球數(shù)據(jù)量的增加,將遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出當(dāng)前主流存儲技術(shù)(包括磁性、光學(xué)和固態(tài)存儲)的容量。尋求全新的存儲介質(zhì)與模式成為一個亟待解決的關(guān)鍵問題。

  據(jù)介紹,脫氧核糖核酸(DNA)因其具有更高的存儲密度、更長的保存時間和更低的功耗需求,已經(jīng)逐漸成為一個備受矚目的“候選者”。目前,DNA信息存儲已初步實(shí)現(xiàn)信息的寫入、存儲和解碼的完備流程。然而,當(dāng)前大多數(shù)工作依賴于大型DNA商業(yè)化的服務(wù)或儀器以實(shí)現(xiàn)信息寫入與讀出,這種非連續(xù)且非專用的模式使DNA信息存儲在更廣的實(shí)際應(yīng)用中面臨諸多挑戰(zhàn)。例如:難以系統(tǒng)性自動化所造成的高讀寫延時,復(fù)雜且昂貴的服務(wù)或儀器所帶來的高準(zhǔn)入門檻,以及閉源性分布式處理所導(dǎo)致的高信息安全風(fēng)險(xiǎn)等。

  針對當(dāng)前DNA信息存儲領(lǐng)域面臨的“寫入—存儲—讀取”一體化難題,該實(shí)驗(yàn)室項(xiàng)目團(tuán)隊(duì)成功開發(fā)了一種基于數(shù)字微流控技術(shù)(Digital Microfluidics, DMF)的全自動化DNA信息存儲解決方案,即DNA-DISK平臺。這一創(chuàng)新平臺實(shí)現(xiàn)了DNA信息存儲全流程的集成化、自動化和小型化。

  DNA-DISK平臺首次采用單堿基酶促合成技術(shù)進(jìn)行信息寫入,有效降低了信息編譯的冗余度,為數(shù)據(jù)寫入提供了一種環(huán)保且經(jīng)濟(jì)的方法;利用焦磷酸測序技術(shù)對DNA進(jìn)行片上測序,實(shí)現(xiàn)了信息的原位解碼。此外,通過熱響應(yīng)凝膠封裝技術(shù),DNA信息得以在芯片上實(shí)現(xiàn)原位封裝,不僅提升了芯片的便攜性,還可以防止DNA的降解。項(xiàng)目團(tuán)隊(duì)設(shè)計(jì)了配套的桌面式儀器,使得DNA信息存儲操作變得像使用U盤一樣便捷,能夠在多種通用場景下完成信息的寫入、存儲和讀取全流程操作。

  為了驗(yàn)證DNA-DISK平臺的實(shí)用性和有效性,團(tuán)隊(duì)利用該平臺對廈門大學(xué)校訓(xùn)“自強(qiáng)不息,止于至善”以及《茉莉花》樂譜文件(共228比特,讀寫延時4.4分鐘/比特)進(jìn)行了編碼和存儲,并成功實(shí)現(xiàn)了信息的準(zhǔn)確解碼。這一成果不僅證明了DNA-DISK平臺的可行性,更展示了其在未來發(fā)展成為“DNA硬盤”的巨大潛力,為DNA信息存儲帶來了新思路。

  該工作在嘉庚創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)室楊朝勇教授和張惠敏副研究員的指導(dǎo)下完成。廈門大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院2021級博士生李堃杰為論文的第一作者。研究工作得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國家自然科學(xué)基金以及嘉庚創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)室科技項(xiàng)目等資助。(記者 李珂)